Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tusc2Q9WVF8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms