Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pacsin2Q9WVE8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacsin2Q9WVE8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacsin2Q9WVE8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms