Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms