Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mixl1Q9WUI0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mixl1Q9WUI0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126 ms