Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ClcnkbQ9WUB6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ClcnkbQ9WUB6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms