Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn7Q9R1S8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn7Q9R1S8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms