Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma1Q9R1P4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma1Q9R1P4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms