Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Psma4Q9R1P0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms