Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek3Q9R0A5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek3Q9R0A5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek3Q9R0A5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms