Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AmfrQ9R049 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AmfrQ9R049 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms