Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsjQ9R014 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsjQ9R014 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsjQ9R014 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsjQ9R014 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsjQ9R014 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsjQ9R014 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsjQ9R014 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CtsjQ9R014 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtsjQ9R014 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtsjQ9R014 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtsjQ9R014 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CtsjQ9R014 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CtsjQ9R014 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CtsjQ9R014 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms