Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtsfQ9R013 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtsfQ9R013 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms