Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp21Q9QZL6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp21Q9QZL6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp21Q9QZL6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms