Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VapbQ9QY76 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms