Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Plxnb3Q9QY40 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plxnb3Q9QY40 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Plxnb3Q9QY40 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Plxnb3Q9QY40 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxnb3Q9QY40 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxnb3Q9QY40 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxnb3Q9QY40 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxnb3Q9QY40 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxnb3Q9QY40 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxnb3Q9QY40 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Plxnb3Q9QY40 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms