Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Foxe3Q9QY14 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxe3Q9QY14 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxe3Q9QY14 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms