Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnip3Q9QXT8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms