Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf3Q9QXK7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf3Q9QXK7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf3Q9QXK7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms