Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad18Q9QXK2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad18Q9QXK2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad18Q9QXK2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms