Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ChmQ9QXG2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChmQ9QXG2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmQ9QXG2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms