Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim44Q9QXA7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim44Q9QXA7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms