Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpc5Q9QX29 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Trpc5Q9QX29 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc5Q9QX29 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms