Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Homer2Q9QWW1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Homer2Q9QWW1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Homer2Q9QWW1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms