Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chaf1aQ9QWF0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chaf1aQ9QWF0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chaf1aQ9QWF0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms