Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Trpc4Q9QUQ5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Trpc4Q9QUQ5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Trpc4Q9QUQ5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Trpc4Q9QUQ5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Trpc4Q9QUQ5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
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Trpc4Q9QUQ5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Trpc4Q9QUQ5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Trpc4Q9QUQ5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Trpc4Q9QUQ5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc4Q9QUQ5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Trpc4Q9QUQ5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Trpc4Q9QUQ5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Trpc4Q9QUQ5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Trpc4Q9QUQ5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Trpc4Q9QUQ5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Trpc4Q9QUQ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc4Q9QUQ5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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