Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tlr4Q9QUK6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr4Q9QUK6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr4Q9QUK6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr4Q9QUK6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr4Q9QUK6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr4Q9QUK6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr4Q9QUK6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr4Q9QUK6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlr4Q9QUK6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms