Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdkl2Q9QUK0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdkl2Q9QUK0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.7 ms