Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUJ7

Acsl4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl4Q9QUJ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acsl4Q9QUJ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acsl4Q9QUJ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acsl4Q9QUJ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms