Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sfmbt1Q9JMD1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfmbt1Q9JMD1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms