Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42ep4Q9JM96 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc42ep4Q9JM96 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc42ep4Q9JM96 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms