Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Reep6Q9JM62 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Reep6Q9JM62 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Reep6Q9JM62 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms