Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
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Rabgef1Q9JM13 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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Rabgef1Q9JM13 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rabgef1Q9JM13 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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Rabgef1Q9JM13 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Rabgef1Q9JM13 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Rabgef1Q9JM13 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Rabgef1Q9JM13 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Rabgef1Q9JM13 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Rabgef1Q9JM13 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rabgef1Q9JM13 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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