Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trpc4apQ9JLV2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc4apQ9JLV2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc4apQ9JLV2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.7 ms