Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn15Q9JLG8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn15Q9JLG8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn15Q9JLG8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn15Q9JLG8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn15Q9JLG8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn15Q9JLG8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn15Q9JLG8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn15Q9JLG8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Capn15Q9JLG8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Capn15Q9JLG8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn15Q9JLG8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn15Q9JLG8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn15Q9JLG8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn15Q9JLG8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn15Q9JLG8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn15Q9JLG8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn15Q9JLG8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn15Q9JLG8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms