Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SacsQ9JLC8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SacsQ9JLC8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SacsQ9JLC8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SacsQ9JLC8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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