Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prg3Q9JL95 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prg3Q9JL95 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prg3Q9JL95 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prg3Q9JL95 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prg3Q9JL95 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prg3Q9JL95 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prg3Q9JL95 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prg3Q9JL95 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prg3Q9JL95 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prg3Q9JL95 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prg3Q9JL95 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prg3Q9JL95 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prg3Q9JL95 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms