Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bace2Q9JL18 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bace2Q9JL18 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms