Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cnot9Q9JKY0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cnot9Q9JKY0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot9Q9JKY0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms