Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nova1Q9JKN6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nova1Q9JKN6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms