Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trem1Q9JKE2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms