Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ap3m1Q9JKC8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ap3m1Q9JKC8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap3m1Q9JKC8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms