Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pard6bQ9JK83 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pard6bQ9JK83 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pard6bQ9JK83 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms