Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Msgn1Q9JK54 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msgn1Q9JK54 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms