Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alyref2Q9JJW6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms