Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ascl3Q9JJR7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ascl3Q9JJR7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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