Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnbip1Q9JJN6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms