Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpf2Q9JJ80 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf2Q9JJ80 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf2Q9JJ80 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms