Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnip1Q9JJ57 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip1Q9JJ57 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip1Q9JJ57 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 770.8 ms