Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cml1Q9JIZ0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cml1Q9JIZ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms