Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppp1r3fQ9JIG4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppp1r3fQ9JIG4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r3fQ9JIG4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms